Ваш браузер не поддерживается.
Некоторые функции этого сайта могут работать некорректно. Для оптимального использования сайта открывайте его в браузере Chrome, Firefox, Safari или Edge.

SARS-CoV-2

Информация о тесте

Xpert® Insight Breast Cancer[1] — это новый тест, разрабатываемый компанией Cepheid. Этот мультиплексный тест на экспрессию мРНК предназначен для измерения экспрессии шести генов (3биомаркеров и 3 средств контроля) в зафиксированной в формалине и залитой парафином ткани рака молочной железы у пациенток с инвазивным раком молочной железы ранней стадии. Взвешенная экспрессия этих генов сочетается с двумя клиническими факторами (размер опухоли и статус лимфоузлов) с использованием запатентованного алгоритма для получения бинарной оценки риска (высокий риск по сравнению с низким риском), которая предназначена для прогнозирования вероятности отдаленного рецидива заболевания в следующие 10 лет (года). 

Этот тест был первоначально разработан Oncomark, ирландской биотехнологической компанией, и изначально назывался OncoMasTRTM. Компании Cepheid и OncoMark начали сотрудничество в 2018 году для изучения разработки версии теста OncoMasTR для использования в системе GeneXpert®. Это сотрудничество было успешным, что, в конечном итоге, привело к приобретению OncoMark и технологии OncoMasTR компанией Cepheid в марте 2021 года. Компания Cepheid намерена вывести тест на рынок под названием Xpert Insight Breast Cancer.

Разработка теста OncoMasTR началась в 2014 году. Ниже приведены основные этапы разработки за последние восемь лет.  

[1] Продукт на стадии разработки. Не для использования в диагностических процедурах. Не было на рассмотрении регулирующих органов.

Год

 

Этап(-ы) разработки

 

2014

Заявка на первоначальное изобретение, относящееся к технологии OncoMasTR, была подана Университетским колледжем Дублина и Тринити-колледжем Дублина совместно с изобретателями Брекеном, Ланиганом и Галлахером.

 

2015

Соответствующая рецензируемая коллегами публикация: 

- Lanigan F et al. Delineating transcriptional networks of prognostic gene signatures refines treatment recommendations for lymph node-negative breast cancer patients. FEBS J 2015; 282:3455-73.

Ключевые моменты исследования-открытия Lanigan et al.:

  • ARACNe: Биоинформатический способ, при котором создаются сети регуляции генов.
  • «Какие гены регулируют прогностические гены в трех существующих прогностических сигнатурах рака молочной железы?» 
  • Была определена панель из десяти «главных транскрипционных регуляторов» (Master Transcriptional Regulators, MTR).
  • Базовый показатель риска был получен из подгруппы MTR, продемонстрировавших прогностическое значение для выживаемости при раке молочной железы (мРНК и уровень белка).

 

2016

Разработка OncoMasTR в OncoMark

Ключевые выводы из работы по разработке продукта:

  • При использовании когорты клинических образцов с долгосрочными исходами («Последовательная когорта», n = 225, 37 отдаленные рецидивы) была разработана и оптимизирована сигнатура 3 генов, включая гены FOXM1, PTTG1 и ZN367 (FPZ, далее).    
  • На основании этой 3-генной сигнатуры были получены три оценки риска на основе FPZ:

     i. Цифровой показатель риска только молекулярной активности (0–100)
ii. Цифровой показатель риска молекулярной и клинической активности (0–10)
iii. Категориальный показатель риска молекулярной и клинической активности (низкий, если риск < 5, высокий, если риск ≥ 5)

 

2017

Соответствующая рецензируемая коллегами публикация: 

- Moran B et al. Master Transcriptional Regulators in Cancer: Discovery via Reverse Engineering Approaches 

and Subsequent Validation. Conceptual bioinformatic framework for finding master control genes. Cancer Res. 2017; 77(9):2186-90.

- Проведено обучение и верификация анализа OncoMasTR с представлением данных на симпозиуме по раку молочной железы в Сан-Антонио (San Antonio Breast Cancer Symposium). 

- Параллельно проводились дальнейшие исследования по разработке и валидации в соответствии с рекомендациями CLSI (аналитическая валидация OncoMasTR в соответствии с рекомендациями CLSI): Прецизионность, линейность, чувствительность, вход РНК, интерференция, стабильность набора.

 

2018

Анализ OncoMasTR был маркирован CE в соответствии с директивой CE-IVD.

Были начаты три независимых внешних клинических валидационных исследования с использованием предварительно заданных оценок риска для анализа OncoMasTR:

  1. TransATAC (n = 646)
  2. TAILORx (n = 404), ирландская подгруппа более широкого исследования TAILORx.
  3. ABCSG-8 (n = 1087)

В совокупности эти исследования включали ЗФЗП образцы, полученные более чем у 2000 женщин с ER-положительным, HER2-отрицательным раком молочной железы ранней стадии (с отрицательным статусом лимфатических узлов или с положительным статусом лимфатических узлов 1)3

Основные выводы из клинических валидационных исследований:

  • Во всех трех исследованиях OncoMasTR был достоверно прогностическим фактором отдаленного рецидива (ДО).
  • В двух исследованиях (подгруппа TransATAC и TAILORx (Ирландия), в которых были доступны данные в поддержку сравнительных анализов, OncoMasTR обеспечивал превосходство прогностической ценности по сравнению с баллом рецидива (RS) Oncotype DXTM.

Компании Cepheid и OncoMark начинают обсуждения сотрудничества для разработки версии теста OncoMasTR для GeneXpert.

 

2019

Компания OncoMark инициировала децентрализованные оценки анализа OncoMasTR в реальных условиях в трех исследовательских центрах:

  1. Больница Святого Джеймса (St James’ Hospital), Ирландия
  2. Больница Бомонт (Beaumont Hospital), Ирландия
  3. Медицинский центр Утрехта (Utrecht Medical Centre), Нидерланды
  4. Лундский университет (Lund University), Швеция

Ключевые выводы из испытаний на бета-сайте и аналитической валидации (аналитическая валидация OncoMasTR в соответствии с руководством CLSI):

  • OncoMasTR демонстрирует надежные аналитические характеристики и потенциально подходит для децентрализованного использования. 
  • Общая прецизионность OncoMasTR была высокой, со стандартным отклонением 0,16 (< 2% от диапазона оценки риска в 10 единицах)
  • Баллы OncoMasTR были сопоставимыми во всем диапазоне входных значений РНК > 100 раз
    • Во всех 4 исследовательских центрах непрерывные коэффициенты корреляции баллов риска OncoMasTR составили 0,94 – 0,96, а соответствие категориальных баллов составило 86 – 96%.

Компании Cepheid и OncoMark заключили официальное соглашение о сотрудничестве с целью разработки версии теста OncoMasTR для теста GeneXpert. 

 

2020

Соответствующая рецензируемая публикация: 

- Buus R et al. Validation of the OncoMasTR risk score in estrogen receptor-positive/HER2-negative patients:
A TransATAC study. Clin Can Res. 2020; 26:623-31.

- Mazo C et al. Multi-gene prognostic signatures and prediction of pathological sponse to neoadjuvant chemotherapy in ER-positive, HER2-negative breast cancer patients. Cancers 2020; 12(5):1133.

Компания Cepheid присваивает торговое название Xpert Insight Breast Cancer версии теста OncoMasTR для GeneXpert.

Компания Cepheid демонстрирует аналитическую эквивалентность теста Xpert Insight Breast Cancer и теста OncoMasTR.

Cepheid демонстрирует достоверность отчетности по оценке риска между Xpert Insight Breast Cancer и OncoMasTR в охарактеризованных образцах.

 

2021

Соответствующая рецензируемая публикация:

- Lynch SM et al. Prognostic value of the 6-gene OncoMasTR assay in hormone receptor-positive HER2-negative early-stage breast cancer: Comparative analysis with   standard clinicopathological factors. Eu J Can. 2021; 152: 78-79.

- Filipits F et al. The OncoMasTR assay predicts distant recurrence in estrogen     receptor-positive, HER2-negative early stage breast cancer: A validation study in ABCSG Trial 8. Clin Cancer Res. 2021 Nov 1;27(21):5931-5938. 

Компания Cepheid приобретает OncoMark и технологию на тест OncoMasTR.

Cepheid демонстрирует клиническую эквивалентность Xpert Insight Breast Cancer по сравнению с OncoMasTR в образцах FFPE с долгосрочными результатами.

Компания Cepheid инициирует исследования данных повседневной клинической практики и клинические валидационные исследования для прототипного теста Xpert Insight Breast Cancer.

 

2022

Соответствующая рецензируемая коллегами публикация:

- Loughman T et al. Analytical Validation of the OncoMasTR Assay, a Novel Multigene Signature for Prediction 
of Distant Recurrence in Estrogen Receptor-Positive, HER2-Negative, Early-Stage Breast Cancer. Clin Chemistry. 2022; 68:6. https://doi.org/10.1093/clinchem/hvac028

Если вы заинтересованы в получении дополнительной информации или участии в совместной оценке компанией Cepheid теста Xpert Insight Breast Cancer RUO, обратитесь в отдел по медицинским, научным вопросам и стратегии компании Cepheid в области онкологии по адресу: MedSci.Oncology@Cepheid.com

Вернуться к началу
Powered by Translations.com GlobalLink OneLink SoftwarePowered By OneLink