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SARS-CoV-2

Informazioni sul test

Xpert® Insight Breast Cancer[1] è un nuovo test in fase di sviluppo presso Cepheid. Questo test di espressione dell’mRNA multiplex è stato progettato per misurare l’espressione di sei geni (3 biomarcatori e 3 controlli) nel tessuto di carcinoma della mammella fissato in formalina e incluso in paraffina di pazienti con carcinoma della mammella invasivo allo stadio iniziale. L’espressione ponderata di questi geni è combinata con due fattori clinici (dimensione del tumore e stato linfonodale) utilizzando un algoritmo proprietario per produrre un punteggio di rischio binario (alto rischio rispetto a basso rischio) progettato per predire la probabilità di recidiva della malattia a distanza nei prossimi 10 anni. 

Questo test è stato originariamente sviluppato da Oncomark, una società biotecnologica con sede in Irlanda, ed è stato inizialmente denominato OncoMasTRTM. Cepheid e OncoMark hanno iniziato a collaborare nel 2018 per esplorare lo sviluppo di una versione del saggio OncoMasTR da utilizzare sul sistema GeneXpert®. Questa collaborazione ha avuto successo, portando in ultima analsi all’acquisizione di OncoMark e della tecnologia OncoMasTR da parte di Cepheid nel marzo del 2021. Cepheid intende commercializzare il test con il nome Xpert Insight Breast Cancer.

Lo sviluppo del test OncoMasTR è iniziato nel 2014. Di seguito sono riportati i punti salienti delle principali tappe di sviluppo nel corso degli ultimi otto anni.  

[1] Prodotto in corso di sviluppo. Non per procedure diagnostiche. Non esaminato da alcun ente regolatore.

Anno

 

Tappe di sviluppo

 

2014

L’invenzione originale relativa alla tecnologia OncoMasTR è stata depositata congiuntamente dall’University College di Dublino e dal Trinity College di Dublino dagli inventori Bracken, Lanigan e Gallagher.

 

2015

Pubblicazione con peer-review pertinente: 

- Lanigan F. et al. Delineating transcriptional networks of prognostic gene signatures refines treatment recommendations for lymph node-negative breast cancer patients. FEB. J 2015; 282:3455-73.

Punti chiave dello studio di scoperta di Lanigan et al.:

  • ARACNE: metodo bioinformatico che realizza reti di regolazione genica.
  • “Quali geni regolano i geni prognostici in tre firme prognostiche esistenti per il carcinoma della mammella?” 
  • È stato identificato un pannello di dieci “regolatori trascrizionali chiave (Master Transcriptional Regulators, MTR)”.
  • Un punteggio di rischio di base è stato realizzato da un sottogruppo di MTR che si sono dimostrati prognostici per la sopravvivenza al carcinoma della mammella (a livello dell’mRNA e delle proteine).

 

2016

Sviluppo di OncoMasTR presso OncoMark

Conclusioni chiave del lavoro di sviluppo del prodotto:

  • È stato sviluppato e ottimizzato utilizzando una coorte di campioni di analisi con esiti a lungo termine (“Coorte consecutiva”, n=225, 37 eventi di recidiva a distanza), una firma a 3 geni, compresi i geni FOXM1, PTTG1, e geni ZN367 (FPZ, di seguito).    
  • Da questa firma a 3 geni sono stati estrapolati tre punteggi di rischio basati su FPZ:

     i.    Un punteggio di rischio numerico solo molecolare (0-100)
             ii.    Un punteggio di rischio numerico molecolare e clinico (0-10)
            iii.    Un punteggio di rischio categorico molecolare e clinico (basso se rischio <5, alto se rischio ≥5)

 

2017

Pubblicazione con peer-review pertinente: 

- Moran B et al. Master Transcriptional Regulators in Cancer: Discovery via Reverse Engineering Approaches 

and Subsequent Validation. Conceptual bioinformatic framework for finding master control genes. Cancer Res. 2017; 77(9):2186-90.

- È stata completata la formazione e la verifica del saggio OncoMasTR, con presentazione dei dati tramite poster al Simposio sul carcinoma mammario di San Antonio. 

- Parallelamente, sono stati condotti ulteriori studi di sviluppo e convalida secondo le linee guida del CLSI (convalida analitica di OncoMasTR secondo le linee guida del CLSI: precisione, linearità, sensibilità, input RNA, interferenza, stabilità del kit.)

 

2018

Il saggio OncoMasTR ha ricevuto la marcatura CE ai sensi della direttiva CE-IVD.

Sono stati avviati tre studi di convalida clinica esterni indipendenti, utilizzando punteggi di rischio prespecificati per il saggio OncoMasTR:

  1. TransATAC (n=646)
  2. TAILORx (n=404), sottogruppo irlandese della più ampia sperimentazione TAILORx.
  3. ABCSG-8 (n=1.087)

Insieme, questi studi hanno incluso campioni FFPE di oltre 2000 donne con carcinoma della mammella in stadio precoce ER-positivo, HER2-negativo (linfonodo negativo o 1-3 linfonodi positivi).

Conclusioni chiave degli studi di convalida clinica:

  • OncoMasTR è risultato significativamente prognostico per la recidiva a distanza (distant recurrence, DR) in tutti e tre gli studi.
  • In due degli studi (TransATAC e il sottogruppo TAILORx (irlandese)) in cui erano disponibili dati a supporto delle analisi comparative, OncoMasTR ha fornito un valore prognostico superiore al punteggio di recidiva (Recurrence Score, RS) di Oncotype DXTM.

Cepheid e OncoMark avviano le discussioni di collaborazione per sviluppare una versione GeneXpert del saggio OncoMasTR.

 

2019

OncoMark ha avviato valutazioni decentralizzate del mondo reale del saggio OncoMasTR presso tre centri:

  1. St James’ Hospital, Irlanda
  2. Beaumont Hospital, Irlanda
  3. Utrecht Medical Centre, Paesi Bassi
  4. Università di Lund, Svezia

Conclusioni chiave dei test beta presso i centri e convalida analitica (convalida analitica di OncoMasTR secondo le linee guida CLSI):

  • OncoMasTR mostra solide prestazioni analitiche ed è potenzialmente adatto per l’uso decentralizzato. 
  • La precisione complessiva di OncoMasTR era elevata, con una deviazione standard di 0,16 (<2% dell’intervallo del punteggio di rischio a 10 unità).
  • I punteggi di OncoMasTR erano coerenti in un intervallo di input dell’RNA >100 volte
    • Tra 4 centri di analisi, i coefficienti di correlazione continui del punteggio di rischio di OncoMasTR erano 0,94 – 0,96 e la concordanza del punteggio categorico era del 86 – 96%.

Cepheid e OncoMark stipulano una collaborazione formale per sviluppare una versione GeneXpert del saggio OncoMasTR. 

 

2020

Pubblicazione con peer review pertinente: 

- Buus R. et al. Validation of the OncoMasTR risk score in estrogen receptor-positive/HER2-negative patients:
A TransATAC study. Clin Can Res. 2020; 26:623-31.

- Mazo C. et al. Multi-gene prognostic signatures and prediction of pathological sponse to neoadjuvant chemotherapy in ER-positive, HER2-negative breast cancer patients. Cancers 2020; 12(5):1133.

Cepheid assegna il nome commerciale Xpert Insight Breast Cancer alla versione GeneXpert del saggio OncoMasTR.

Cepheid dimostra l’equivalenza analitica tra il saggio Xpert Insight Breast Cancer e il saggio OncoMasTR.

Cepheid dimostra la fedeltà dell’indicazione del punteggio di rischio tra Xpert Insight Breast Cancer e OncoMasTR in campioni caratterizzati.

 

2021

Pubblicazione con peer review pertinente:

- Lynch S.M. et al. Prognostic value of the 6-gene OncoMasTR assay in hormone receptor-positive HER2-negative early-stage breast cancer: Comparative analysis with standard clinicopathological factors. Eu J Can. 2021; 152: 78-79.

- Filipits F. et al. The OncoMasTR assay predicts distant recurrence in estrogen receptor-positive, HER2-negative early stage breast cancer: A validation study in ABCSG Trial 8. Clin Cancer Res. 2021 Nov 1;27(21):5931-5938. 

Cepheid acquisisce OncoMark e il saggio OncoMasTR.

Cepheid dimostra l’equivalenza clinica tra Xpert Insight Breast Cancer e OncoMasTR in campioni FFPE con esiti a lungo termine.

Cepheid avvia studi di prova e convalida clinica del mondo reale per il prototipo del test Xpert Insight Breast Cancer.

 

2022

Pubblicazione con peer-review pertinente:

- Loughman T. et al. Analytical Validation of the OncoMasTR Assay, a Novel Multigene Signature for Prediction
of Distant Recurrence in Estrogen Receptor-Positive, HER2-Negative, Early-Stage Breast Cancer. Clin Chemistry. 2022; 68:6. https://doi.org/10.1093/clinchem/hvac028

Se si è interessati a saperne di più o a collaborare con Cepheid in una valutazione collaborativa del test Xpert Insight Breast Cancer RUO, contattare il team Cepheid Medical and Scientific Affairs and Strategy for Oncology all’indirizzo: MedSci.Oncology@Cepheid.com

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