OncoMark

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OXpert® Insight Breast Cancer[1] é um novo teste em desenvolvimento na Cepheid. Este teste de expressão de ARNm múltiplo foi concebido para medir a expressão de seis genes (3 biomarcadores e 3 controlos) em tecido de cancro da mama fixado em formalina e embebido em parafina de doentes com cancro da mama invasivo na fase inicial. A expressão ponderada destes genes é combinada com dois fatores clínicos (tamanho do tumor e estado nodal) utilizando um algoritmo proprietário para produzir uma pontuação de risco binário (risco elevado vs. risco baixo) que é concebida para prever a probabilidade de recorrência da doença distante nos próximos 10 anos. 

Este teste foi originalmente desenvolvido pela Oncomark, uma empresa de biotecnologia sediada na Irlanda, e foi inicialmente denominado OncoMasTRTM. A Cepheid e a OncoMark começaram a colaborar em 2018 para explorar o desenvolvimento de uma versão do teste OncoMasTR para utilização no sistema GeneXpert®. Esta colaboração foi bem-sucedida, levando em última instância à aquisição da OncoMark e da tecnologia OncoMasTR pela Cepheid em março de 2021. A Cepheid pretende comercializar o teste com o nome Xpert Insight Breast Cancer.

O desenvolvimento do teste OncoMasTR teve início em 2014. Abaixo encontram-se destaques dos principais marcos de desenvolvimento nos últimos oito anos.

[1] Produto em desenvolvimento. Não se destina a procedimentos de diagnóstico. Não revisto por nenhuma entidade reguladora.

Ano

 

Marco(s) de desenvolvimento

 

2014

A invenção original relacionada com a tecnologia OncoMasTR foi apresentada em conjunto pela University College of Dublin e Trinity College Dublin com os inventores Bracken, Lanigan e Gallagher.

 

2015

Publicação relevante revista por pares: 

- Lanigan F et al. Delineating transcriptional networks of prognostic gene signatures refines treatment recommendations for lymph node-negative breast cancer patients. FEBS J 2015; 282:3455-73.

Pontos-chave do estudo de descoberta de Lanigan et al.:

  • ARACNe: Método bioinformático que constrói redes de regulação genética.
  • “Que genes regulam os genes prognósticos em três assinaturas de prognóstico existentes para o cancro da mama?” 
  • Foi identificado um painel de dez ‘Reguladores Transcricionais Principais’ (MTR).
  • Uma pontuação de risco básica foi construída a partir de um subconjunto de MTR que mostraram ser prognósticos para a sobrevivência do cancro da mama (nível de proteína e ARNm).

 

2016

Desenvolvimento do OncoMasTR na OncoMark

Principais conclusões do trabalho de desenvolvimento do produto:

  • Utilizando uma coorte de amostras clínicas com resultados a longo prazo (“Coorte consecutiva”, n=225, 37 eventos de recorrência distantes), foi desenvolvida e otimizada uma assinatura de 3 genes, incluindo os genes FOXM1, PTTG1 e ZN367 (doravante FPZ).    
  • A partir desta assinatura de 3 genes, foram derivadas três pontuações de risco baseadas em FPZ:

     i.    Uma pontuação apenas de risco numérico molecular (0-100)
             ii.    Uma pontuação de risco numérico molecular e clínico (0-10)
            iii.    Uma pontuação de risco categórico molecular e clínico (baixo se risco <5, alto se risco ≥5)

 

2017

Publicação relevante revista por pares: 

- Moran B et al. Master Transcriptional Regulators in Cancer: Discovery via Reverse Engineering Approaches 

and Subsequent Validation. Conceptual bioinformatic framework for finding master control genes. Cancer Res. 2017; 77(9):2186-90.

- Foi realizada formação e verificação do teste OncoMasTR, com apresentação de cartazes dos dados no Simpósio de Cancro da Mama de San Antonio. 

- Paralelamente, foram realizados mais estudos de desenvolvimento e validação de acordo com as diretrizes do CLSI (Validação analítica do OncoMasTR de acordo com as diretrizes do CLSI: precisão, linearidade, sensibilidade, ARN de entrada, interferência, estabilidade do kit.

 

2018

O teste OncoMasTR teve a marcação CE ao abrigo da diretiva CE relativa aos dispositivos médicos de diagnóstico in vitro.

Foram iniciados três estudos de validação clínica externos independentes, utilizando pontuações de risco pré-especificadas para o teste OncoMasTR:

  1. TransATAC (n=646)
  2. TAILORx (n=404), subconjunto irlandês do ensaio TAILORx mais amplo.
  3. ABCSG-8 (n=1087)

Em conjunto, estes estudos incluíram amostras FFPE de mais de 2000 mulheres com cancro da mama em fase inicial positivo para ER e negativo para HER2 (gânglios linfáticos negativos ou 1-3 gânglios linfáticos positivos)

Principais conclusões dos estudos de validação clínica:

  • O OncoMasTR foi significativamente prognóstico para recorrência distante (DR) nos três estudos.
  • Em dois dos estudos (TransATAC e o subconjunto TAILORx (irlandês) onde existiam dados disponíveis para apoiar análises comparativas, o OncoMasTR forneceu um valor prognóstico superior ao Oncotype DXTMRecurrence Score (RS).

A Cepheid e a OncoMark iniciam discussões de colaboração para desenvolver uma versão GeneXpert do teste OncoMasTR.

 

2019

A OncoMark iniciou avaliações descentralizadas do mundo real do teste OncoMasTR em três centros:

  1. St James’ Hospital, Irlanda
  2. Beaumont Hospital, Irlanda
  3. Utrecht Medical Centre, Países Baixos
  4. Lund University, Suécia

Principais conclusões dos testes do local beta e validação analítica (Validação analítica do OncoMasTR de acordo com as diretrizes do CLSI):

  • O OncoMasTR apresenta um desempenho analítico robusto e é potencialmente adequado para utilização descentralizada. 
  • A precisão geral do OncoMasTR foi elevada, com um desvio padrão de 0,16 (<2% do intervalo de pontuação de risco de 10 unidades)
  • As pontuações OncoMasTR foram consistentes num intervalo de entrada de ARN >100 vezes
    • Em 4 centros de teste, os coeficientes de correlação de pontuação de risco do OncoMasTR contínuos foram 0,94 – 0,96 e a concordância de pontuação categórica foi 86 – 96%.

A Cepheid e a OncoMark participam numa colaboração formal para desenvolver uma versão GeneXpert do teste OncoMasTR. 

 

2020

Publicação revista por pares relevante: 

- Buus R et al. Validation of the OncoMasTR risk score in estrogen receptor-positive/HER2-negative patients:
A TransATAC study. Clin Can Res. 2020; 26:623-31.

- Mazo C et al. Multi-gene prognostic signatures and prediction of pathological sponse to neoadjuvant chemotherapy in ER-positive, HER2-negative breast cancer patients. Cancers 2020; 12(5):1133.

A Cepheid atribui o nome comercial do Xpert Insight Breast Cancer à versão GeneXpert do teste OncoMasTR.

A Cepheid demonstra equivalência analítica do teste Xpert Insight Breast Cancer com o teste OncoMasTR.

A Cepheid demonstra a exatidão do relatório de pontuação de risco entre o Xpert Insight Breast Cancer e o OncoMasTR em amostras caracterizadas.

 

2021

Publicação revista por pares relevante:

- Lynch SM et al. Prognostic value of the 6-gene OncoMasTR assay in hormone receptor-positive HER2-negative early-stage breast cancer: Comparative analysis with   standard clinicopathological factors. Eu J Can. 2021; 152: 78-79.

- Filipits F et al. The OncoMasTR assay predicts distant recurrence in estrogen     receptor-positive, HER2-negative early stage breast cancer: A validation study in ABCSG Trial 8. Clin Cancer Res. 2021 Nov 1;27(21):5931-5938. 

A Cepheid adquire a OncoMark e o teste OncoMasTR.

A Cepheid demonstra a equivalência clínica do Xpert Insight Breast Cancer com o OncoMasTR em amostras FFPE com resultados a longo prazo.

A Cepheid inicia estudos de validação clínica e evidências no mundo real para o teste de protótipo do Xpert Insight Breast Cancer.

 

2022

Publicação relevante revista por pares:

- Loughman T et al. Analytical Validation of the OncoMasTR Assay, a Novel Multigene Signature for Prediction 
of Distant Recurrence in Estrogen Receptor-Positive, HER2-Negative, Early-Stage Breast Cancer. Clin Chemistry. 2022; 68:6. https://doi.org/10.1093/clinchem/hvac028

Se estiver interessado em saber mais ou para colaborar com a Cepheid numa avaliação colaborativa do teste Xpert Insight Breast Cancer RUO, contacte a equipa de Assuntos Médicos e Científicos de Estratégia da Cepheid para Oncologia em: MedSci.Oncology@Cepheid.com

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