Vigilancia proactiva para garantizar una detección amplia de la cepa de la gripe

Virus: cambios y derivas

Los virus cambian constantemente debido a las mutaciones. Existen dos mecanismos principales que causan estos cambios. La deriva genética es un cambio gradual en la composición genética de un virus debido a una serie de mutaciones genéticas menores.¹ En los virus de la gripe, la deriva genética provoca pequeños cambios en las proteínas de la superficie viral. Por otro lado, el cambio genético es una modificación abrupta e importante en la composición genética de un virus, que a menudo crea una nueva cepa. Genetic shift creates substantially different surface proteins and can give influenza viruses of animal origin the ability to infect humans, potentially causing outbreaks in human populations.^1.

Los cambios en las secuencias genéticas virales pueden afectar al rendimiento de las pruebas diagnósticas moleculares. Si una prueba está diseñada para detectar una secuencia viral en particular y esa secuencia cambia debido a una mutación, la prueba podría no detectar el virus. El virus de la gripe o influenza es propenso a dichas mutaciones.  

Para evitar impactos en las pruebas de la gripe basadas en PCR, Cepheid diseña cada prueba para detectar diversos genes de la gripe. Esto reduce el impacto de una mutación en una secuencia genética dada, ya que hay otras secuencias únicas que permiten la detección (es decir, redundancia de dianas). Para la gripe A, se incluyen tres dianas génicas para detectar cepas adaptadas a los seres humanos y diversas cepas aviares. Además, se incluyen dos dianas génicas para la gripe B.

Vigilancia proactiva del rendimiento de las pruebas

Cepheid supervisa estrechamente los datos de vigilancia de las cepas para estar al día con la naturaleza cambiante de los virus de la gripe. Cepheid utiliza pruebas in silico, así como pruebas in vitro para monitorizar la cobertura de las cepas de la gripe de sus pruebas diagnósticas. La prueba in silico (es decir, los experimentos realizados por ordenador) consulta las bases de datos de las secuencias disponibles para predecir la capacidad de una prueba de detectar las cepas de gripe pertinentes evaluando cómo de bien las secuencias de la prueba de PCR coinciden con las secuencias diana virales. El análisis in silico de Cepheid utiliza todas las secuencias de la gripe disponibles en la base de datos de la Iniciativa mundial para compartir todos los datos de la gripe (Global Initiative on Sharing All Influenza Data, GISAID) (https://gisaid.org/). A diciembre de 2023, había disponibles más de 18.000 secuencias de la gripe A humana y más de 7.000 secuencias de la gripe B humana, y todas se incluyeron en el análisis.

También se realizan pruebas in vitro (experimentos realizados en un tubo de ensayo o placa de laboratorio) de aislados del virus de la gripe utilizando el panel anual de Reactividad analítica de la gripe del Centro de Administración de Alimentos y Medicamentos para la Evaluación e Investigación de Productos Biológicos (Food and Drug Administration Center for Biologics Evaluation and Research, FDA CBER). El panel CBER de la FDA contiene virus humanos actuales, incluidas las cepas recomendadas por la Organización Mundial de la Salud para la vacuna anual contra la gripe.

Para garantizar la cobertura y el rendimiento continuos de las cepas de la gripe, Cepheid realiza pruebas in silico e in vitro para sus pruebas Xpert® Xpress Flu/RSV y Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus (denominadas aquí colectivamente Xpert Xpress). Estas pruebas de diagnóstico in vitro de sistema multiplex contienen múltiples dianas de la gripe.

Detección de la cepa de la gripe A aviar

Con las crecientes preocupaciones sobre la gripe aviar, que incluyen casos recientes en humanos,² la cobertura de la cepa aviar, incluida la cepa H5N1, es crucial para las pruebas diagnósticas. A agosto de 2023, había más de 5.000 secuencias del subtipo de gripe A aviar disponibles en GISAID e incluidas en el análisis in silico de Cepheid. Se incluyeron cepas de gripe aviar preocupantes recientes, como el clado 2.3.4.4b de H5N1 Guangdong de 2024, H5N1/A/Cambodia/NPH230032/2023 y H3N8/A/Guangdong/ZS-2023SF005/2023.

Results from the combination of in silico analysis and in vitro testing demonstrate that the Xpert Xpress influenza tests will detect a wide range of current human and avian influenza virus strains, and is predicted to detect the highly pathogenic 2024 H5N1 Guangdong clade 2.3.4.4b that has been reported in outbreaks in dairy cattle and humans in the U.S.^2-4

Preparación para brotes

La capacidad de una prueba diagnóstica para detectar con precisión diferentes cepas de un virus puede permitir la detección y vigilancia tempranas de cepas nuevas o emergentes, determinar diagnósticos seguros para el tratamiento y las medidas de aislamiento, y potencialmente informar sobre estrategias de salud pública de preparación para los brotes.

El intercambio continuo de datos, que incluye las valiosas contribuciones de la comunidad científica que generó y compartió datos de secuenciación de la gripe a través de la Iniciativa GISAID, junto con una vigilancia proactiva continua, posicionará las iniciativas de salud pública y global para detectar cepas emergentes a tiempo y evitar brotes en el futuro.

Póngase en contacto con nosotros para solicitar el boletín de asuntos médicos/científicos de Cepheid: Inclusividad de las pruebas de Cepheid para la gripe, 2023, para obtener un informe completo de los métodos y resultados de este análisis.

Obtenga más información sobre las pruebas de la gripe de Cepheid aquí.