Qu’appelle-t-on PCR ? Comprendre la magie

Bonjour, je m’appelle Dr Fred Tenover et je suis vice-président des affaires scientifiques chez Cepheid, une société de diagnostic moléculaire.

Parlons un peu des tests diagnostiques en laboratoire clinique. Les tests diagnostiques jouent un rôle critique dans pratiquement tous les aspects de la prise en charge des patients, du diagnostic initial à la sélection d’antibiotiques ou d’antiviraux pour les infections, en passant par les décisions de prévention des infections. La COVID-19 a certainement illustré le rôle clé que joue la réaction en chaîne par polymérase (également appelée PCR) dans le diagnostic et la prise en charge des patients présentant des symptômes respiratoires. Mais la PCR est également utilisée pour faciliter le diagnostic de nombreuses maladies, notamment la septicémie, la tuberculose, les infections sexuellement transmissibles et les infections nosocomiales.

Mais qu’est-ce que la PCR ? En termes simples, c’est la magie du laboratoire. Imaginons que vous avez perdu vos clés de voiture. Puisque vous n’avez qu’une seule copie des clés, elles peuvent être n’importe où et donc assez difficiles à trouver. Mais que se passerait-il si vous pouviez faire apparaître dix mille, voire cent mille copies de vos clés de voiture ? Cela permet de trouver les clés très facilement. Comment ai-je fait cela ? C’est magique. Lorsqu’il s’agit de trouver la présence d’une infection chez un patient, la magie réside dans la PCR.

La PCR est un processus enzymatique qui produit littéralement des millions de copies de petits segments d’ADN ou d’ARN qui sont uniques aux micro-organismes responsables de la maladie. Chaque micro-organisme possède une séquence d’acide nucléique caractéristique, la PCR nous permet donc de détecter un agent infectieux directement dans un échantillon clinique beaucoup plus rapidement que les méthodes de diagnostic traditionnelles, qu’il s’agisse de SARS-CoV-2, de tuberculose, de gonorrhée ou même des virus qui provoquent des épidémies hospitalières de maladie diarrhéique comme le norovirus. Et nous pouvons souvent le faire en une heure ou moins en utilisant la PCR.

Tout comme tous les hôpitaux n’offrent pas la même qualité de soins, toutes les solutions de test PCR ne sont pas de même qualité. Certains sont plus rapides, d’autres plus sensibles, d’autres plus spécifiques. Certains sont beaucoup plus faciles à utiliser, et d’autres, comme ceux disponibles sur le système GeneXpert de Cepheid, combinent tous ces attributs. Les tests ont une sensibilité et une spécificité élevées bien documentées, et la technologie peut être utilisée tout aussi facilement en biologie délocalisée, comme dans les cliniques de soins d’urgence ou les laboratoires de médecins, qu’à l’hôpital ou dans les grands laboratoires de référence, car il s’agit de la même cartouche pour chaque emplacement.

En ce qui concerne les tests diagnostiques, en particulier le test PCR, nous devons nous préoccuper de plusieurs problèmes majeurs. Le premier est la précision du test, c’est-à-dire la sensibilité et la spécificité. La sensibilité fait référence à la capacité du test à identifier tous les patients atteints de la maladie. La spécificité, en revanche, fait référence à la capacité d’un test à être négatif chez tous les patients qui ne sont pas atteints de cette maladie. Vous ne voulez pas dire par erreur à un patient qu’il a une infection alors qu’il ne l’a pas. Par exemple, une sensibilité élevée signifie que vous détectez avec précision tous les patients qui viennent à votre hôpital et qui sont atteints de COVID-19 en raison de SARS-CoV-2, tandis que la spécificité élevée du test signifie que les patients atteints d’autres infections des voies respiratoires seront négatifs.

Prises ensemble, la sensibilité et la spécificité décrivent la précision du test PCR. À présent, il existe deux autres attributs d’un test PCR qui méritent votre attention : la vitesse et la simplicité. La flexibilité du système GeneXpert permet de traiter simultanément entre 1 et 80 cartouches, et grâce à 22 tests approuvés, autorisés ou autorisés par la FDA, vous pouvez consolider de nombreux tests PCR sur un seul instrument.

Encore une fois, la magie qui permet le diagnostic est la PCR, et avec Cepheid, c’est la PCR Plus. Nous vous remercions pour votre temps.